En la Unidad Ejecutora Lillo trabajamos desarrollando métodos computacionales para análisis filogenéticos y biogeográficos. Varias de nuestras contribuciones han tenido un impacto significativo en el campo del análisis filogenético.
En este grupo trabajan como investigadores Dolores Casagranda, Santiago Catalano, y Pablo Goloboff; ha hecho también contribuciones importantes al grupo Joan Salvador Arias (quien se mudó al IBS, en Misiones, en Mayo del 2023). Completan el grupo de trabajo Martín Morales (como Técnico Profesional en el área Informática), junto con Natalia González Piñeres y Omar Saguir (como estudiantes doctorales).
Los investigadores del grupo tienen muchas colaboraciones a nivel nacional (con investigadores del Museo Argentino de Ciencias Naturales, Museo Feruglio, Instituto IDEA, Instituto Darwinion, etc.), e internacional (con investigadores del American Museum of Natural History, Cornell University, University of Chicago, Chinese University of Hong Kong, Institute of Vertebrate Paleontology and Paleoanthropology, British Museum of Natural History, Gothenburg Botanical Garden, Boulder Colorado University, etc.).
En el ámbito de la biogeografía histórica, se han desarrollado en el grupo programas para análisis de áreas de endemismo (VNDM/NDM, de Goloboff, que aplica métodos propuestos por Szumik y Goloboff), y para análisis de vicarianza y distribuciones ancestrales (VIP y GEM, de Arias, que aplican métodos para inferir historias distribucionales sobre un árbol).
En el ámbito de la reconstrucción filogenética, nuestros trabajos más importantes son en el contexto del análisis de parsimonia. Goloboff desarrolló en los años ’90 los programas Nona y Pee-Wee, que fueron luego reemplazados por TNT (escrito en colaboración con James Farris, entonces del Naturhistoriska riksmuseet de Estocolmo y Kevin Nixon, de Cornell University, mantenido hoy en colaboración con Morales). TNT (hoy con más de 9,000 citas por Google Scholar) es el programa de parsimonia más utilizado. Incorpora métodos para análisis de grandes datasets, para pesado de caracteres, para análisis de caracteres con dependencias (e.g. inaplicables, o con dependencias funcionales), y para análisis morfométricos. Los métodos para análisis de datos morfométricos implementados en TNT (desarrollados en colaboración entre Catalano y Goloboff) no tienen equivalente en ningún otro programa de análisis filogenético. Lo mismo sucede con la variedad de métodos para pesado de caracteres implementados en TNT (e.g. para pesado de transformaciones, para tomar en cuenta entradas faltantes, para pesar grupos de caracteres, para utilizar distintas funciones de pesado, etc.). TNT está subsidiado por la Willi Hennig Society, y puede descargarse gratuitamente de https://www.lillo.org.ar/phylogeny/tnt/.
Los métodos desarrollados en el grupo de trabajo han sido utilizados en el análisis de la filogenia de muchos grupos de alto perfil, a menudo publicados en journals como Nature o Science.