Alberga un total de 45.000 ejemplares de algas, helechos, hongos, líquenes y musgos. Sus inicios se remontan en la década del 30 con la primera colección de helechos realizada por el sabio Miguel Lillo.
Se mantiene actualizado por colecciones efec- tuadas por el personal del mismo herbario, y por intercambio o canje con otros Herbarios Nacio-nales y Extranjeros.
Cuenta con gran cantidad de registros biológicos en formatos y soportes diversos, desde libros de inventario manuscritos hasta una base de datos relacionales (Herbalil).