La Colección de Invertebrados Fósiles de la Fundación Miguel Lillo (FML–IPI) fue creada en el año 1990, ante la necesidad de disponer de un repositorio para el resguardo seguro de material de invertebrados fósiles estudiados por el grupo de trabajo de la Sección Paleoinvertebrados del Instituto de Paleontología de la Dirección de Geología de la Institución.
Al abundante material obtenido en diversas campañas geopaleontológicas realizadas por dicho grupo, se incorporó, más tarde, material recuperado por otros investigadores.
