La Colección Ficológica que se encuentra en el Herbario de la Fundación Miguel Lillo (FML) posee 1657 ejemplares herborizados pertenecientes al período 1814-1979, en su mayoría algas macroscópicas. Los ejemplares fueron donados por prestigiosas Instituciones, entre las que se pueden mencionar: el Herbario del Jardín Botánico de Nueva York, el Museo de Hungría, el Herbario Algológico de Rumania y el Herbario Farlow de la Universidad de Harvard, entre otros.

A partir de 1974 se registra la permanente incorporación de muestras algales de agua dulce que están conservadas en envases plásticos y fijadas con formaldehido. El número de estas muestras, hasta el presente, es de aproximadamente 1500, provenientes principalmente de las provincias del NOA y permite incrementar el conocimiento de la biodiversidad de este grupo.