Líneas de trabajo En la actualidad las principales investigaciones se llevan a cabo en el campo de la ecología. Se llevan a cabo estudios sobre dieta, nidificación, migraciones altitudinales y estacionales, riqueza específica, además del papel de las aves como indicadoras de impacto ambiental. Manejo y conservación de vida silvestre. Colecciones Este Instituto cuenta con importantes colecciones de aves y mamíferos, originadas en diferentes momentos. Colección Shipton, adquirida en el año 1938 al Sr. Stewart Shipton (1869-1939), consta de aves, mamíferos argentinos y africanos, reptiles y peces. En la sección se encuentran depositadas las aves del Noroeste Argentino, preparadas en pedestal, en un total de 623 especies y 1.205 ejemplares. Colección Ornitológica, cuyo material más antiguo data del año 1880. Está representada por 24 órdenes, 82 familias, 1.076 especies y 16.664 ejemplares, principalmente de la fauna Argentina, de países limítrofes y en menor proporción de otros países americanos y europeos. Dentro de la colección se hallan agrupadas las especies la provincia de Tucumán (572 ejemplares pertenecientes a 471 especies y 62 familias). Está informatizada y dispone de un catálogo de consulta. La colección oológica, consta de 578 huevos pertenecientes a 66 especies y la osteológica con 72 esqueletos de 14 especies. La Colección Mamíferos Lillo, con ejemplares colectados desde 1901 en adelante, del país y en especial del Noroeste Argentino, además del resto de Latinoamérica, Africa y Europa. Cuenta con aproximadamente de 5.216 ejemplares, los que pertenecen a 300 especies, el material en su mayoría se encuentra preparado en piel, con sus respectivas partes de esqueletos, también material conservado en alcohol. La Sección Mastozoología cuenta además, con una colección exclusivamente de esqueletos y cráneos, la Colección Rusconi, adquirida al Sr. Rusconi en el año 1958, de 330 ejemplares, número que ascendió actualmente a 511 ejemplares cuyos grupos más representados son: Marsupiales, Quirópteros, Roedores y Carnívoros.
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