El Herbario Digilio cuenta con 14.500 ejemplares de hongos correspondientes a colecciones de referencia, com la del Dr. Digilio (1945) y la del Dr. Singer (1950); además contiene la colección de Myxomycetes más grande del país con colecciones nacionales y exsicatas que fueron enviadas por el Herbario del Jardín Botánico de Nueva York, el Museo Hist. Natur. Vidobenensi, la Flora Austro-Hungarica y algunas datan de fines del siglo XIX. Además, las colecciones se mantienen permanentemente actualizadas con la incorporación de nuevos materiales provenientes de los viajes de campo realizados principalmente, en las provincias del Noroeste, y además por el intercambio de ejemplares con otras Instituciones nacionales y extranjeras.

El Herbario cuenta además, con una importante colección de liquenes, que si bien no incluyen colecciones de referencia, los 9.400 ejemplares depositados ponen de manifiesto la diversidad específica en áreas del Noroeste como en otras zonas del país.

El herbario ha publicados catálogos y folletos de divulgación, obras destinadas a los investigadores, aficionados y público en general con la intención de difundir sus objetivos, utilidades y funcionamiento.